Title (eng)
The position of the RPL3 gene in a gene network relevant to diabetic microangiopathy
Parallel title (deu)
Die Position des RPL3 Gens in einem Gennetzwerk relevant für diabetische Mikroangiopathie
Author
Hannelore Lechtermann
Advisor
Thomas Decker
Assessor
Thomas Decker
Abstract (deu)
Diabetische Mikroangiopathie bezeichnet eine durch Hyperglykämie induzierte, krankhafte Veränderung der kleinen Blutgefäße. Die charakteristische Verdickung der kapillaren Basalmembran gilt als typisches Anzeichen der in Folge dieser Krankheit auftretenden, gestörten Mikrozirkulation dieser Gefäße. Diabetische Mikroangiopathie wird klinisch in Nephropathie, Retinopathie und Neuropathie klassifiziert.
Zur Ursachenforschung dieser Krankheit auf molekularer, genetischer Ebene wurden Gene, welche mit diabetischen Mikroangiopathie in Verbindung gebracht werden, hinsichtlich ihres Expressionsprofiles verglichen. Diese Profile wurden mittels High Throughput TaqMan Quantitative PCR ermittelt und zum Design eines genetischen Netzwerkes in silicio verwendet. Das so entwickelte Netzwerk umfasste schlussendlich 37 Gene und spiegelte die funktionellen Verbindungen zwischen den einzelnen Netzwerkpartner wider. Mit Hilfe der hierfür verwendeten Algorithmen konnten auch unterschiedliche Expressionsprofile der am Netzwerkdesign beteiligten Gene analysiert und eine hohe Korrelation im Expressionsmuster zwischen den zwei Kandidatengenen, Btf3 und Rpl3, identifiziert werden. Diese Verbindung wurde auf Proteinebene durch Immunoblotting nachgewiesen, wodurch ein unilateraler Pathway identifiziert wurde, in welchem überexpremiertes BTF3 Protein die Expression des RPL3 Proteins fördert. Zusätzlich wurde Rpl3 durch Btf3 zu vier der fünf identifizierten Schlüsselgenen des Netzwerkes verbunden, wodurch angenommen werden kann, das die Btf3/Rpl3 Wechselbeziehung eine zentrale Rolle in der Entstehung und dem Fortschreiten von diabetischer Mikroangiopathie spielt.
Abstract (eng)
Diabetic microangiopathy is a severe complication of long term diabetes mellitus. It systemically affects the blood capillaries and is characterized by a thickening of their basal membrane as a surrogate marker for impaired microcirculation. Clinically, this disease can be classified into nephropathy, neuropathy and retinopathy. To get a closer insight into the genetic factors causing diabetic microangiopathy the expression profiles of a variety of genes contributing to diabetes were obtained by high throughput TaqMan quantitative PCR and used to generate a gene network in silicio. The final network comprised 37 genes and displayed the regulatory interactions of these participants. The network algorithm also identified a high correlation in the expression profiles of two candidate genes, Btf3 and Rpl3. Confirmation by immunoblotting revealed a unilateral pathway, in which ectopically overexpressed BTF3 protein stimulated the expression of RPL3 protein. Thus, Btf3 connected Rpl3 to four out of those five genes having a vast number of regulatory interactions. Therefore, we propose that the Btf3/Rpl3 protein pair can be considered potential molecular players of diabetic microangiopathy.
Keywords (eng)
RPL3genetic networksdiabetic microangiopathy
Keywords (deu)
RPL3Gennetzwerkediabetische Mikroangiopathie
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1262368
rdau:P60550 (deu)
100 S. : Ill., graph. Darst.
Number of pages
102
Association (deu)
Title (eng)
The position of the RPL3 gene in a gene network relevant to diabetic microangiopathy
Parallel title (deu)
Die Position des RPL3 Gens in einem Gennetzwerk relevant für diabetische Mikroangiopathie
Author
Hannelore Lechtermann
Abstract (deu)
Diabetische Mikroangiopathie bezeichnet eine durch Hyperglykämie induzierte, krankhafte Veränderung der kleinen Blutgefäße. Die charakteristische Verdickung der kapillaren Basalmembran gilt als typisches Anzeichen der in Folge dieser Krankheit auftretenden, gestörten Mikrozirkulation dieser Gefäße. Diabetische Mikroangiopathie wird klinisch in Nephropathie, Retinopathie und Neuropathie klassifiziert.
Zur Ursachenforschung dieser Krankheit auf molekularer, genetischer Ebene wurden Gene, welche mit diabetischen Mikroangiopathie in Verbindung gebracht werden, hinsichtlich ihres Expressionsprofiles verglichen. Diese Profile wurden mittels High Throughput TaqMan Quantitative PCR ermittelt und zum Design eines genetischen Netzwerkes in silicio verwendet. Das so entwickelte Netzwerk umfasste schlussendlich 37 Gene und spiegelte die funktionellen Verbindungen zwischen den einzelnen Netzwerkpartner wider. Mit Hilfe der hierfür verwendeten Algorithmen konnten auch unterschiedliche Expressionsprofile der am Netzwerkdesign beteiligten Gene analysiert und eine hohe Korrelation im Expressionsmuster zwischen den zwei Kandidatengenen, Btf3 und Rpl3, identifiziert werden. Diese Verbindung wurde auf Proteinebene durch Immunoblotting nachgewiesen, wodurch ein unilateraler Pathway identifiziert wurde, in welchem überexpremiertes BTF3 Protein die Expression des RPL3 Proteins fördert. Zusätzlich wurde Rpl3 durch Btf3 zu vier der fünf identifizierten Schlüsselgenen des Netzwerkes verbunden, wodurch angenommen werden kann, das die Btf3/Rpl3 Wechselbeziehung eine zentrale Rolle in der Entstehung und dem Fortschreiten von diabetischer Mikroangiopathie spielt.
Abstract (eng)
Diabetic microangiopathy is a severe complication of long term diabetes mellitus. It systemically affects the blood capillaries and is characterized by a thickening of their basal membrane as a surrogate marker for impaired microcirculation. Clinically, this disease can be classified into nephropathy, neuropathy and retinopathy. To get a closer insight into the genetic factors causing diabetic microangiopathy the expression profiles of a variety of genes contributing to diabetes were obtained by high throughput TaqMan quantitative PCR and used to generate a gene network in silicio. The final network comprised 37 genes and displayed the regulatory interactions of these participants. The network algorithm also identified a high correlation in the expression profiles of two candidate genes, Btf3 and Rpl3. Confirmation by immunoblotting revealed a unilateral pathway, in which ectopically overexpressed BTF3 protein stimulated the expression of RPL3 protein. Thus, Btf3 connected Rpl3 to four out of those five genes having a vast number of regulatory interactions. Therefore, we propose that the Btf3/Rpl3 protein pair can be considered potential molecular players of diabetic microangiopathy.
Keywords (eng)
RPL3genetic networksdiabetic microangiopathy
Keywords (deu)
RPL3Gennetzwerkediabetische Mikroangiopathie
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1262369
Number of pages
102
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