Title (eng)
Virus production in the Baltic Sea
Parallel title (deu)
Virenproduktion in der Ostsee
Author
Lisa Scharnreitner
Advisor
Gerhard Herndl
Assessor
Gerhard Herndl
Abstract (deu)
Viren sind neben Protisten einer der größten Mortalitätsfaktoren für Prokaryoten im Meer. Diese Studie untersuchte den Einfluss von Viren auf Prokaryoten in der Redoxkline der Ostsee. Wir haben die Frequenz von infizierten Zellen, die Virenproduktion und das Auftreten von lysogenen Viren bestimmt. Weiters wurde der Unterschied zwischen Viren-Reduktionsansatz und ungefilterten Proben getestet. Um Die Virenproduktion und die Infektion von Archaeen zu bestimmen wurden Bakterin mit Antibiotika inhibiert. Die relative Abundanz von Bakterien, Crenarchaeen und Sulfurimonas ssp. wurde mit CARD-FISH bestimmt. Die Frequenz von lysogenen Viren wurde durch Induktion mit Mitomycin C bestimmt, es konnten aber keine lysogenen Viren detektiert werden. Die Frequenz von infizierten Zellen war mit dem Viren-Reduktionsansatz bei 11 % in der suboxischen Zone und < 3 % in der anoxischen und der Übergangszone. Das weist darauf hin, dass Viren einen größeren Einfluss in der suboxischen Zone haben. Durch Antibiotika konnte festgestellt werden, dass Viren einen großen Einfluss auf Crenarchaeen haben, vor allem in der suboxischen Zone.
Abstract (eng)
Viruses are, along with protists, one of the major prokaryotic mortality factors in the marine environment. This study focuses on the viral impact on prokaryotes throughout the redoxcline of the central Baltic Sea. We determined the frequency of lytically-infected prokaryotic cells (FIC), frequency of lysogenically-infected cells (FLC) and virus production rates (VP). Also, determining these parameters, the difference between the virus-dilution approach and unfiltered incubations was tested. To estimate the potential contribution of Archaea to VP and FIC, Bacteria were inhibited by antibiotic treatment. The relative abundance of Bacteria, Crenarchaeota, and Sulfurimonas ssp. was determined by CARD-FISH. FLC determined by prophage induction through mitomycin C could not be detected, whereas FIC estimated by the virus-dilution approach ranged from 11 % in the suboxic zone to < 3 % in the transition and anoxic zone, indicating a stronger influence of viruses in the suboxic than in the anoxic zone. Incubations with antibiotics inhibiting bacterial protein synthesis demonstrated a high contribution of Crenarchaeota to FIC and VP in all the different zones of the water column, with a major viral influence in the suboxic zone.
Keywords (eng)
Virus productionFrequency of infected cellsVirusesBaltic SeaRedoxcline
Keywords (deu)
VirenproduktionFrequenz von infizierten ZellenVirenOstsee/ Redoxkline
Subject (deu)
Virologie
Type (deu)
Masterarbeit
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1303471
DOI
10.25365/thesis.29778
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29480.01849.119461-9
URI
https://utheses.univie.ac.at/detail/26549
Extent (deu)
42 S. : graph. Darst.
Number of pages
43
Association (deu)
Fakultät für Lebenswissenschaften
Members (1)
Title (eng)
Virus production in the Baltic Sea
Parallel title (deu)
Virenproduktion in der Ostsee
Author
Lisa Scharnreitner
Abstract (deu)
Viren sind neben Protisten einer der größten Mortalitätsfaktoren für Prokaryoten im Meer. Diese Studie untersuchte den Einfluss von Viren auf Prokaryoten in der Redoxkline der Ostsee. Wir haben die Frequenz von infizierten Zellen, die Virenproduktion und das Auftreten von lysogenen Viren bestimmt. Weiters wurde der Unterschied zwischen Viren-Reduktionsansatz und ungefilterten Proben getestet. Um Die Virenproduktion und die Infektion von Archaeen zu bestimmen wurden Bakterin mit Antibiotika inhibiert. Die relative Abundanz von Bakterien, Crenarchaeen und Sulfurimonas ssp. wurde mit CARD-FISH bestimmt. Die Frequenz von lysogenen Viren wurde durch Induktion mit Mitomycin C bestimmt, es konnten aber keine lysogenen Viren detektiert werden. Die Frequenz von infizierten Zellen war mit dem Viren-Reduktionsansatz bei 11 % in der suboxischen Zone und < 3 % in der anoxischen und der Übergangszone. Das weist darauf hin, dass Viren einen größeren Einfluss in der suboxischen Zone haben. Durch Antibiotika konnte festgestellt werden, dass Viren einen großen Einfluss auf Crenarchaeen haben, vor allem in der suboxischen Zone.
Abstract (eng)
Viruses are, along with protists, one of the major prokaryotic mortality factors in the marine environment. This study focuses on the viral impact on prokaryotes throughout the redoxcline of the central Baltic Sea. We determined the frequency of lytically-infected prokaryotic cells (FIC), frequency of lysogenically-infected cells (FLC) and virus production rates (VP). Also, determining these parameters, the difference between the virus-dilution approach and unfiltered incubations was tested. To estimate the potential contribution of Archaea to VP and FIC, Bacteria were inhibited by antibiotic treatment. The relative abundance of Bacteria, Crenarchaeota, and Sulfurimonas ssp. was determined by CARD-FISH. FLC determined by prophage induction through mitomycin C could not be detected, whereas FIC estimated by the virus-dilution approach ranged from 11 % in the suboxic zone to < 3 % in the transition and anoxic zone, indicating a stronger influence of viruses in the suboxic than in the anoxic zone. Incubations with antibiotics inhibiting bacterial protein synthesis demonstrated a high contribution of Crenarchaeota to FIC and VP in all the different zones of the water column, with a major viral influence in the suboxic zone.
Keywords (eng)
Virus productionFrequency of infected cellsVirusesBaltic SeaRedoxcline
Keywords (deu)
VirenproduktionFrequenz von infizierten ZellenVirenOstsee/ Redoxkline
Subject (deu)
Virologie
Type (deu)
Masterarbeit
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1303472
Number of pages
43
Association (deu)
Fakultät für Lebenswissenschaften
License
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