Title (eng)
Characterisation of transcribed intergenic Polycomb target sites in mammalian embryonic stem cells
Parallel title (deu)
Chatakterisierung von transkribierten intergenischen Polycomb Zielsequenzen in embryonalen Stammzellen
Parallel title (eng)
Characterisation of transcribed intergenic Polycomb target sites in mammalian embryonic stem cells
Author
Melita Ticevic
Advisor
Leonie Ringrose
Assessor
Leonie Ringrose
Abstract (deu)
Polycomb-Proteine sind in Drosophila und Vertebraten hoch konserviert und bekannt dafür, dass sie die Genexpression verschiedener kodierender Sequenzen regulieren. Sie können die Genexpression reduzieren und dieses Expressionsmuster für längere Zeiträume beziehungsweise während der Differenzierung beibehalten. Polycomb-Proteine agieren über sogennante Polycomb Response Elements (PREs). DNA-bindende Proteine können in Drosophila bestimmte Sequenzen in den PREs erkennen und an diese binden, wobei sie durch diesen Mechanismus auch Polycomb-Proteine zu den PREs rekrutieren. Die Suche nach Vertebraten-PREs erweist sich als schwierig, da Polycomb-Protein viele verschiedene Isoformen in Vertebraten aufweisen und über verschiedene Mechanismen Polycomb-Proteine in verschiedenen Geweben rekrutieren können. In dieser Studie habe ich mich bemüht zum Verständnis des Mechanismus von Vertebraten-PREs beizutragen, indem ich transkribierte intergenische Polycomb Zielsequenzen (TIPs) in das Genom von murinen embryonalen Stamzellen integriert und untersucht habe.
Abstract (eng)
The highly conserved Polycomb group (PcG) of proteins regulate and maintain gene expression patterns in Drosophila and vertebrates. PcG proteins have the ability to repress or silence gene expression. They act through cis-regulatory Polycomb response elements (PREs). In Drosophila, sequence-specific DNA binding proteins can bind to PREs and this way recruit PcG proteins to PREs. In mammals, identification of PREs is more complex because vertebrates show more diverse PcG protein complexes and moreover, PcG proteins are involved in many different processes and tissues during development. In this study I want to contribute to the understanding of vertebrate PREs by analyzing the functional properties of transcribed intergenic Polycomb target sites (TIPs). For this I have integrated TIPs into the genome of murine embryonic stem cells and performed reporter assays.
Keywords (eng)
Polycomb group of ProteinsPolycomb response elements (PREs)Embryonic stem cellstranscribed intergenic Polycomb target sites (TIPs)
Keywords (deu)
Polycomb-ProteinePolycomb Response Elements (PREs)Embryonale Stammzellentranskribierte intergenische Polycomb Zielsequenzen
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1304233
rdau:P60550 (deu)
79 S. : Ill., graph. Darst.
Number of pages
81
Association (deu)
Title (eng)
Characterisation of transcribed intergenic Polycomb target sites in mammalian embryonic stem cells
Parallel title (deu)
Chatakterisierung von transkribierten intergenischen Polycomb Zielsequenzen in embryonalen Stammzellen
Parallel title (eng)
Characterisation of transcribed intergenic Polycomb target sites in mammalian embryonic stem cells
Author
Melita Ticevic
Abstract (deu)
Polycomb-Proteine sind in Drosophila und Vertebraten hoch konserviert und bekannt dafür, dass sie die Genexpression verschiedener kodierender Sequenzen regulieren. Sie können die Genexpression reduzieren und dieses Expressionsmuster für längere Zeiträume beziehungsweise während der Differenzierung beibehalten. Polycomb-Proteine agieren über sogennante Polycomb Response Elements (PREs). DNA-bindende Proteine können in Drosophila bestimmte Sequenzen in den PREs erkennen und an diese binden, wobei sie durch diesen Mechanismus auch Polycomb-Proteine zu den PREs rekrutieren. Die Suche nach Vertebraten-PREs erweist sich als schwierig, da Polycomb-Protein viele verschiedene Isoformen in Vertebraten aufweisen und über verschiedene Mechanismen Polycomb-Proteine in verschiedenen Geweben rekrutieren können. In dieser Studie habe ich mich bemüht zum Verständnis des Mechanismus von Vertebraten-PREs beizutragen, indem ich transkribierte intergenische Polycomb Zielsequenzen (TIPs) in das Genom von murinen embryonalen Stamzellen integriert und untersucht habe.
Abstract (eng)
The highly conserved Polycomb group (PcG) of proteins regulate and maintain gene expression patterns in Drosophila and vertebrates. PcG proteins have the ability to repress or silence gene expression. They act through cis-regulatory Polycomb response elements (PREs). In Drosophila, sequence-specific DNA binding proteins can bind to PREs and this way recruit PcG proteins to PREs. In mammals, identification of PREs is more complex because vertebrates show more diverse PcG protein complexes and moreover, PcG proteins are involved in many different processes and tissues during development. In this study I want to contribute to the understanding of vertebrate PREs by analyzing the functional properties of transcribed intergenic Polycomb target sites (TIPs). For this I have integrated TIPs into the genome of murine embryonic stem cells and performed reporter assays.
Keywords (eng)
Polycomb group of ProteinsPolycomb response elements (PREs)Embryonic stem cellstranscribed intergenic Polycomb target sites (TIPs)
Keywords (deu)
Polycomb-ProteinePolycomb Response Elements (PREs)Embryonale Stammzellentranskribierte intergenische Polycomb Zielsequenzen
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1304234
Number of pages
81
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