Title (eng)
Resource stoichiometry and the growth rate hypothesis in Verrucomicrobium spinosum
Parallel title (deu)
Ressourcen-Stöchiometrie und die "growth rate hypothesis" in Verrucomicrobium spinosum
Author
Christian Schwarz
Advisor
Tom Battin
Assessor
Tom Battin
Abstract (deu)
In dieser Studie untersuchte ich die Anwendbarkeit der “growth rate hypothesis“ (GRH) eines wichtigen Konzepts im Feld der biologischen Stöchiometrie (welche stöchiometrische Nährstoffverfügbarkeit mit dem davon abhängigen physiologischen Verhalten von Mikroorganismen koppelt) auf den in natürlichen Ökosystemen häufigen Organismus Verrucomicrobium spinosum. Um dieses Ziel zu erreichen erweiterte ich eine bestehende Methode, zur Quantifizierung von DNS und RNS. Um diese Nukleinsäuren innerhalb der Zelle mit einem einzigen Fluoreszenzfarbstoff (RiboGreen) direkt quantifizieren zu können. Damit untersuchte ich die Rahmenbedingungen unten denen die GRH Anwendung auf unseren Modellorganismus findet, und bewertete ihren Nutzen in der Umlegung auf natürliche Ökosysteme. Ich konnte zeigen, dass die GRH im Fall der Phosphatlimitierung auf V. spinosum anwendbar ist. Und dass diese Beziehung verloren geht, falls ein anderer Nährstoff zum limitierenden Faktor wird. Ergänzend beschäftigte ich mich mit den weiteren Auswirkungen unserer Ergebnisse in Anwendung auf natürliche Ökosysteme und den damit einhergehenden Problemen.
Abstract (eng)
In this study I tried to evaluate the applicability of the growth rate hypothesis (GRH), a main idea within the framework of biological stoichiometry, on Verrucomicrobium spinosum — a bacterium that is commonly found in various environmental ecosystems. In order to do so, I further developed a method to quantify DNA and RNA within the cell using a single fluorescence dye (RiboGreen). Furthermore, I assessed under which circumstances the GRH is applicable on V. spinosum and tried to set these constraints in context with its environmental applicability. I showed that the GRH is applicable to our model organism under P limitation, and the occurrence of a decoupling effect if another nutrient becomes limiting. Furthermore, I discuss the applicability of the GRH on natural environments and the adherent problems.
Keywords (eng)
resource stoichiometryVerrucomicrobium spinosumthe growth rate hypothesis
Keywords (deu)
Ressourcen-StöchiometrieVerrucomicrobium spinosum
Subject (deu)
Methoden und Techniken in den Naturwissenschaften
Type (deu)
Diplomarbeit
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1251704
DOI
10.25365/thesis.1980
URN
urn:nbn:at:at-ubw:1-29758.01498.463261-9
URI
https://utheses.univie.ac.at/detail/1643
Extent (deu)
33 S. : graph. Darst.
Number of pages
34
Association (deu)
Fakultät für Lebenswissenschaften
Members (1)
Title (eng)
Resource stoichiometry and the growth rate hypothesis in Verrucomicrobium spinosum
Parallel title (deu)
Ressourcen-Stöchiometrie und die "growth rate hypothesis" in Verrucomicrobium spinosum
Author
Christian Schwarz
Abstract (deu)
In dieser Studie untersuchte ich die Anwendbarkeit der “growth rate hypothesis“ (GRH) eines wichtigen Konzepts im Feld der biologischen Stöchiometrie (welche stöchiometrische Nährstoffverfügbarkeit mit dem davon abhängigen physiologischen Verhalten von Mikroorganismen koppelt) auf den in natürlichen Ökosystemen häufigen Organismus Verrucomicrobium spinosum. Um dieses Ziel zu erreichen erweiterte ich eine bestehende Methode, zur Quantifizierung von DNS und RNS. Um diese Nukleinsäuren innerhalb der Zelle mit einem einzigen Fluoreszenzfarbstoff (RiboGreen) direkt quantifizieren zu können. Damit untersuchte ich die Rahmenbedingungen unten denen die GRH Anwendung auf unseren Modellorganismus findet, und bewertete ihren Nutzen in der Umlegung auf natürliche Ökosysteme. Ich konnte zeigen, dass die GRH im Fall der Phosphatlimitierung auf V. spinosum anwendbar ist. Und dass diese Beziehung verloren geht, falls ein anderer Nährstoff zum limitierenden Faktor wird. Ergänzend beschäftigte ich mich mit den weiteren Auswirkungen unserer Ergebnisse in Anwendung auf natürliche Ökosysteme und den damit einhergehenden Problemen.
Abstract (eng)
In this study I tried to evaluate the applicability of the growth rate hypothesis (GRH), a main idea within the framework of biological stoichiometry, on Verrucomicrobium spinosum — a bacterium that is commonly found in various environmental ecosystems. In order to do so, I further developed a method to quantify DNA and RNA within the cell using a single fluorescence dye (RiboGreen). Furthermore, I assessed under which circumstances the GRH is applicable on V. spinosum and tried to set these constraints in context with its environmental applicability. I showed that the GRH is applicable to our model organism under P limitation, and the occurrence of a decoupling effect if another nutrient becomes limiting. Furthermore, I discuss the applicability of the GRH on natural environments and the adherent problems.
Keywords (eng)
resource stoichiometryVerrucomicrobium spinosumthe growth rate hypothesis
Keywords (deu)
Ressourcen-StöchiometrieVerrucomicrobium spinosum
Subject (deu)
Methoden und Techniken in den Naturwissenschaften
Type (deu)
Diplomarbeit
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1251705
Number of pages
34
Association (deu)
Fakultät für Lebenswissenschaften
License
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