Title (eng)
Characterization of Thaumarchaeota isolated from the Northern Adriatic Sea
Parallel title (deu)
Charakterisierung von Thaumarchaeota isoliert aus dem nördlichen Adriatischen Meer
Author
Barbara Bayer
Advisor
Gerhard Herndl
Assessor
Gerhard Herndl
Abstract (deu)
Die Entdeckung der in aquatischen und terrestrischen Lebensräumen ubiquitär vorkommenden Ammoniak oxidierenden Thaumarchaeota hat zu einem vermehrten Interesse geführt, deren Physiologie und ökologische Funktion besser zu verstehen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden die physiologische und genomische Charakterisierung von zwei AOA Spezies der Gattung Nitrosopumilus beschrieben, welche aus den Oberflächengewässern des nördlichen Adriatischen Meeres isoliert wurden. Die Entdeckung von phylogenetisch nah verwandten, jedoch funktionell deutlich unterschiedlichen Vertretern der Gattung Nitrosopumilus in der Nordadria, gibt einen Einblick in die Funktionsvielfalt der marinen Thaumarchaeota und weist auf eine mögliche Nischendifferenzierung zwischen den verschiedenen eng verwandten Arten hin.
Abstract (eng)
The discovery of ubiquitous ammonia-oxidizing Thaumarchaota in aquatic and terrestrial environments has led to an increased interest to further understand their physiology and ecological function. Here we report the physiological and genomic characterization of two Nitrosopumilus isolates (D3C and NF5) originating from the surface waters of the Northern Adriatic Sea. The finding of phylogenetically close but functionally distinctive members of the Nitrosopumilus genus in the Northern Adriatic Sea indicates a larger functional diversity of marine mesophilic Thaumarchaeota than previously assumed and points towards a possible niche differentiation among several closely related species.
Keywords (eng)
Thaumarchaotaammonia oxidationNitrosopumilusAdriatic SeaureaseamoAureCenzyme kineticsphotolyasealternative substrate
Keywords (deu)
ThaumarchaotaAmmoniak OxidationNitrosopumilusAdriatisches MeerUreaseamoAureCEnzymkinetikPhotolyasealternative Substrate
Subject (deu)
Type (deu)
Extent (deu)
46 S. : Ill., graph. Darst.
Number of pages
52
Members (1)
Title (eng)
Characterization of Thaumarchaeota isolated from the Northern Adriatic Sea
Parallel title (deu)
Charakterisierung von Thaumarchaeota isoliert aus dem nördlichen Adriatischen Meer
Author
Barbara Bayer
Abstract (deu)
Die Entdeckung der in aquatischen und terrestrischen Lebensräumen ubiquitär vorkommenden Ammoniak oxidierenden Thaumarchaeota hat zu einem vermehrten Interesse geführt, deren Physiologie und ökologische Funktion besser zu verstehen. Im Rahmen dieser Arbeit wurden die physiologische und genomische Charakterisierung von zwei AOA Spezies der Gattung Nitrosopumilus beschrieben, welche aus den Oberflächengewässern des nördlichen Adriatischen Meeres isoliert wurden. Die Entdeckung von phylogenetisch nah verwandten, jedoch funktionell deutlich unterschiedlichen Vertretern der Gattung Nitrosopumilus in der Nordadria, gibt einen Einblick in die Funktionsvielfalt der marinen Thaumarchaeota und weist auf eine mögliche Nischendifferenzierung zwischen den verschiedenen eng verwandten Arten hin.
Abstract (eng)
The discovery of ubiquitous ammonia-oxidizing Thaumarchaota in aquatic and terrestrial environments has led to an increased interest to further understand their physiology and ecological function. Here we report the physiological and genomic characterization of two Nitrosopumilus isolates (D3C and NF5) originating from the surface waters of the Northern Adriatic Sea. The finding of phylogenetically close but functionally distinctive members of the Nitrosopumilus genus in the Northern Adriatic Sea indicates a larger functional diversity of marine mesophilic Thaumarchaeota than previously assumed and points towards a possible niche differentiation among several closely related species.
Keywords (eng)
Thaumarchaotaammonia oxidationNitrosopumilusAdriatic SeaureaseamoAureCenzyme kineticsphotolyasealternative substrate
Keywords (deu)
ThaumarchaotaAmmoniak OxidationNitrosopumilusAdriatisches MeerUreaseamoAureCEnzymkinetikPhotolyasealternative Substrate
Subject (deu)
Type (deu)
Number of pages
52