Title (eng)
DNA methylation status of MAOB as biomarker for diagnosis of Alzheimer’s disease
Parallel title (deu)
DNA Methylierungsgrad von MAOB als Biomarker für die Diagnose von Alzheimer
Author
Denana Avdic
Advisor
Margit Cichna-Markl
Assessor
Margit Cichna-Markl
Abstract (deu)
Alzheimer ist eine neurodegenerative Erkrankung und die häufigste Form von Demenz. Kennzeichnend für die Erkrankung sind die Bildung von neurofibrillären Bündeln und senilen Plaques und ein langsam fortschreitender Verlust der Nervenzellen. Da Alzheimer bislang nur post mortem sicher diagnostiziert werden kann, ist die Entwicklung eines Biomarkers für eine frühe Diagnose von großer Bedeutung.
Im Gegensatz zu der früheren Form von Alzheimer (EOAD), welche durch Mutation hervorgerufen wird, wird vermutet, dass die spät beginnende Form von Alzheimer (LOAD) durch epigenetische Modifikationen entsteht. Alzheimerpatienten zeigen oft eine niedrige Folat- und Homozysteinplasmakonzentration, welche zu einer Hypomethylierung des Genoms führen kann. Daher könnte der DNA Methylierungsgrad für eine frühe Diagnose von Alzheimer herangezogen werden.
In der Masterarbeit wurde untersucht, ob der DNA Methylierungsgrad der Monoamino oxidase B (MAOB) als Biomarker für eine frühe Diagnose von Alzheimer geeignet ist, da vorherige Studien eine Überexpression des MAOB Proteins bei Alzheimerpatienten gezeigt hatten.
Zunächst wurde eine Pyrosequenziermethode entwickelt und optimiert, um den Methylierungsgrad von 11 CpGs in der Promotorregion von MAOB bestimmen zu können. Anschließend wurden mit Hilfe der Pyrosequenziermethode DNA Extrakte aus Vollblutproben von 40 Alzheimerpatienten und 40 gesunden Kontrollen analysiert. Die DNA Extrakte wurden von unseren Kooperationspartnern Dr. Maria Zellner und Dr. Ellen Umlauf (Institut für Physiologie, Medizinische Universität Wien) zur Verfügung gestellt. Zusätzlich wurden Poolproben, welche durch das Mischen von DNA Extrakten unterschiedlicher Personen hergestellt wurden, analysiert.
Mit statistischen Tests wurden keine signifikanten Unterschiede im DNA Methylierungsgrad der CpGs zwischen Alzheimerpatienten und gesunden Kontrollen gefunden. Signifikante Unterschiede wurden weder für DNA Extrakte von individuellen Personen noch für DNA Extrakte von Poolproben erhalten
Abstract (eng)
Alzheimer’s disease (AD) is a neurodegenerative disorder and the most commonly diagnosed form of age-related dementia. Pathological hallmarks of AD are neurofibrillary tangles, senile plaques and neuronal cell loss. Currently, AD can only be diagnosed post mortem and therefore there is a great interest to develop biomarkers for an early diagnosis of AD.
In contrast to early onset AD (EOAD), which is caused by gene mutations, late onset AD (LOAD), the most prevalent type of AD, seems to be mediated by aberrant epigenetic modifications. High homocysteine and low folate levels in plasma of AD patients have been associated with hypomethylation of the genome. Aberrant DNA methylation patterns could therefore be suitable biomarkers for the early diagnosis of AD.
In the master thesis, the suitability of the DNA methylation status of monoamine oxidase B (MAOB) as biomarker for the diagnosis of AD was investigated. In previous studies, the MOAB protein has been found to be overexpressed in AD patients.
At the beginning, a pyrosequencing method was developed, allowing to determine the methylation status of 11 CpGs in the MAOB promoter. The pyrosequencing method was then applied to the analysis of DNA extracts from whole blood samples of 40 AD patients and 40 healthy controls. DNA extracts were provided by our cooperation partners from the Institute of Physiology, Medical University of Vienna. In addition, pools of DNA extracts were obtained, prepared by mixing DNA extracts from individual persons.
Statistical analyses of the methylation levels determined showed that the methylation status of the CpGs in DNA from whole blood of AD patients was not significantly different from that found in healthy controls. Significant differences were neither found for DNA extracts from individual persons nor for DNA extract pools.
Keywords (eng)
DNA methylation statusAlzheimer's diseaseMAOB
Keywords (deu)
DNA MethylierungsgradAlzheimerMAOB
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1330362
rdau:P60550 (deu)
III, 68, 13 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Number of pages
88
Association (deu)
Title (eng)
DNA methylation status of MAOB as biomarker for diagnosis of Alzheimer’s disease
Parallel title (deu)
DNA Methylierungsgrad von MAOB als Biomarker für die Diagnose von Alzheimer
Author
Denana Avdic
Abstract (deu)
Alzheimer ist eine neurodegenerative Erkrankung und die häufigste Form von Demenz. Kennzeichnend für die Erkrankung sind die Bildung von neurofibrillären Bündeln und senilen Plaques und ein langsam fortschreitender Verlust der Nervenzellen. Da Alzheimer bislang nur post mortem sicher diagnostiziert werden kann, ist die Entwicklung eines Biomarkers für eine frühe Diagnose von großer Bedeutung.
Im Gegensatz zu der früheren Form von Alzheimer (EOAD), welche durch Mutation hervorgerufen wird, wird vermutet, dass die spät beginnende Form von Alzheimer (LOAD) durch epigenetische Modifikationen entsteht. Alzheimerpatienten zeigen oft eine niedrige Folat- und Homozysteinplasmakonzentration, welche zu einer Hypomethylierung des Genoms führen kann. Daher könnte der DNA Methylierungsgrad für eine frühe Diagnose von Alzheimer herangezogen werden.
In der Masterarbeit wurde untersucht, ob der DNA Methylierungsgrad der Monoamino oxidase B (MAOB) als Biomarker für eine frühe Diagnose von Alzheimer geeignet ist, da vorherige Studien eine Überexpression des MAOB Proteins bei Alzheimerpatienten gezeigt hatten.
Zunächst wurde eine Pyrosequenziermethode entwickelt und optimiert, um den Methylierungsgrad von 11 CpGs in der Promotorregion von MAOB bestimmen zu können. Anschließend wurden mit Hilfe der Pyrosequenziermethode DNA Extrakte aus Vollblutproben von 40 Alzheimerpatienten und 40 gesunden Kontrollen analysiert. Die DNA Extrakte wurden von unseren Kooperationspartnern Dr. Maria Zellner und Dr. Ellen Umlauf (Institut für Physiologie, Medizinische Universität Wien) zur Verfügung gestellt. Zusätzlich wurden Poolproben, welche durch das Mischen von DNA Extrakten unterschiedlicher Personen hergestellt wurden, analysiert.
Mit statistischen Tests wurden keine signifikanten Unterschiede im DNA Methylierungsgrad der CpGs zwischen Alzheimerpatienten und gesunden Kontrollen gefunden. Signifikante Unterschiede wurden weder für DNA Extrakte von individuellen Personen noch für DNA Extrakte von Poolproben erhalten
Abstract (eng)
Alzheimer’s disease (AD) is a neurodegenerative disorder and the most commonly diagnosed form of age-related dementia. Pathological hallmarks of AD are neurofibrillary tangles, senile plaques and neuronal cell loss. Currently, AD can only be diagnosed post mortem and therefore there is a great interest to develop biomarkers for an early diagnosis of AD.
In contrast to early onset AD (EOAD), which is caused by gene mutations, late onset AD (LOAD), the most prevalent type of AD, seems to be mediated by aberrant epigenetic modifications. High homocysteine and low folate levels in plasma of AD patients have been associated with hypomethylation of the genome. Aberrant DNA methylation patterns could therefore be suitable biomarkers for the early diagnosis of AD.
In the master thesis, the suitability of the DNA methylation status of monoamine oxidase B (MAOB) as biomarker for the diagnosis of AD was investigated. In previous studies, the MOAB protein has been found to be overexpressed in AD patients.
At the beginning, a pyrosequencing method was developed, allowing to determine the methylation status of 11 CpGs in the MAOB promoter. The pyrosequencing method was then applied to the analysis of DNA extracts from whole blood samples of 40 AD patients and 40 healthy controls. DNA extracts were provided by our cooperation partners from the Institute of Physiology, Medical University of Vienna. In addition, pools of DNA extracts were obtained, prepared by mixing DNA extracts from individual persons.
Statistical analyses of the methylation levels determined showed that the methylation status of the CpGs in DNA from whole blood of AD patients was not significantly different from that found in healthy controls. Significant differences were neither found for DNA extracts from individual persons nor for DNA extract pools.
Keywords (eng)
DNA methylation statusAlzheimer's diseaseMAOB
Keywords (deu)
DNA MethylierungsgradAlzheimerMAOB
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1330363
Number of pages
88
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