You are here: University of Vienna PHAIDRA Detail o:1392621
Title (deu)
Chemische Synthese eines SemiSWEET-Transporters
Author
Franziska Albler
Adviser
Christian Friedrich Wilhelm Becker
Assessor
Christian Friedrich Wilhelm Becker
Abstract (deu)
Membranproteine sind wichtige Ansatzpunkte und Zielmoleküle in der Forschung und Entwicklung von Medikamenten. Sie sind in essentiellen zellulären Prozessen involviert, unter anderem im Austausch von Informationen und Materialen, wie z.B. Kohlenhydraten, zwischen dem Zellinneren und dem Zelläußeren. In dieser Arbeit liegt der Fokus auf einem Membranprotein aus dem Bakterium Vibrio sp. (Stamm N418) und zwar dem bestuntersuchtesten SemiSWEET, einem Mono- und Disaccharidtransporter. Üblicherweise wird das membranständige Zuckertransporterprotein der Spezies Vibrio per Expression aus E. Coli gewonnen. In dieser Arbeit wird erstmals gezeigt, dass es auf rein synthetischem Wege, mittels Festphasenpeptidsynthese (SPPS), gefolgt von nativer chemischen Ligation (NCL), aufgebaut werden kann. Durch den eingeschlagenen organischen Syntheseweg soll die Möglichkeit und der Zugang zur chemischen Modifizierung am Protein erleichtert werden. Dies eröffnet wiederum Optionen biochemische sowie mechanistische Fragestellungen zu verstehen, pKa-Werte der Aminosäureseitenketten am Protein zu beeinflussen, sowie gezielte strukturelle Änderungen vorzunehmen bzw. einzubringen, um somit die Eigenschaften des Proteins beeinflussen zu können. Dies stellt einen wichtigen Ansatzpunkt bei der Generierung neuer Therapeutika dar.
Abstract (eng)
Membrane proteins are important molecules, not only for research and development of new pharmaceuticals, but they are also involved in many key processes, for example the exchange of information and small molecules, like carbohydrates, through the cell membrane. In this work we want to focus on the best known SemiSWEET from the bacterium Vibrio sp. (strain N418), a di- and monosaccharide transporter protein in prokaryotic membranes. The common approach for the preparation of this SemiSWEET is the expression in E. Coli. In this work we demonstrate the total synthesis of this membrane protein via SPPS (Solid Phase Peptide Synthesis), followed by native chemical ligation (NCL). This utilized organic pathway facilitates the access and opportunity of modifications of the protein. This potentially enables solving biochemical and mechanistical questions, manipulation of the pKa-values of amino acid sidechains and specific changes in the structure of the protein to influence those characteristics. This approach is an essential tool for the development of new therapeutics.
Keywords (eng)
protein chemistrysugar transporterSemiSWEETsnative chemical ligation (NCL)SPPSHPLCMS
Keywords (deu)
ProteinchemieZuckertransporterSemiSWEETsNative Chemische Ligation (NCL)SPPSHPLCMS
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1392621
rdau:P60550 (deu)
60 Seiten : Illustrationen, Diagramme
Number of pages
60
Association (deu)
Members (1)
Title (deu)
Chemische Synthese eines SemiSWEET-Transporters
Author
Franziska Albler
Abstract (deu)
Membranproteine sind wichtige Ansatzpunkte und Zielmoleküle in der Forschung und Entwicklung von Medikamenten. Sie sind in essentiellen zellulären Prozessen involviert, unter anderem im Austausch von Informationen und Materialen, wie z.B. Kohlenhydraten, zwischen dem Zellinneren und dem Zelläußeren. In dieser Arbeit liegt der Fokus auf einem Membranprotein aus dem Bakterium Vibrio sp. (Stamm N418) und zwar dem bestuntersuchtesten SemiSWEET, einem Mono- und Disaccharidtransporter. Üblicherweise wird das membranständige Zuckertransporterprotein der Spezies Vibrio per Expression aus E. Coli gewonnen. In dieser Arbeit wird erstmals gezeigt, dass es auf rein synthetischem Wege, mittels Festphasenpeptidsynthese (SPPS), gefolgt von nativer chemischen Ligation (NCL), aufgebaut werden kann. Durch den eingeschlagenen organischen Syntheseweg soll die Möglichkeit und der Zugang zur chemischen Modifizierung am Protein erleichtert werden. Dies eröffnet wiederum Optionen biochemische sowie mechanistische Fragestellungen zu verstehen, pKa-Werte der Aminosäureseitenketten am Protein zu beeinflussen, sowie gezielte strukturelle Änderungen vorzunehmen bzw. einzubringen, um somit die Eigenschaften des Proteins beeinflussen zu können. Dies stellt einen wichtigen Ansatzpunkt bei der Generierung neuer Therapeutika dar.
Abstract (eng)
Membrane proteins are important molecules, not only for research and development of new pharmaceuticals, but they are also involved in many key processes, for example the exchange of information and small molecules, like carbohydrates, through the cell membrane. In this work we want to focus on the best known SemiSWEET from the bacterium Vibrio sp. (strain N418), a di- and monosaccharide transporter protein in prokaryotic membranes. The common approach for the preparation of this SemiSWEET is the expression in E. Coli. In this work we demonstrate the total synthesis of this membrane protein via SPPS (Solid Phase Peptide Synthesis), followed by native chemical ligation (NCL). This utilized organic pathway facilitates the access and opportunity of modifications of the protein. This potentially enables solving biochemical and mechanistical questions, manipulation of the pKa-values of amino acid sidechains and specific changes in the structure of the protein to influence those characteristics. This approach is an essential tool for the development of new therapeutics.
Keywords (eng)
protein chemistrysugar transporterSemiSWEETsnative chemical ligation (NCL)SPPSHPLCMS
Keywords (deu)
ProteinchemieZuckertransporterSemiSWEETsNative Chemische Ligation (NCL)SPPSHPLCMS
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:1392622
Number of pages
60
Association (deu)