Hintergrund: Auf Checkpoint-Inhibitoren (CPI) basierende Immuntherapien, die auf die CTLA-4 - oder PD-1/PD-L1 Signalwege abzielen, haben beeindruckende Erfolge bei der Behandlung verschiedener Krebsarten geleistet. Die Situation vom Testen neuartiger Krebsimmuntherapien in frühen klinischen Studien (Phase-1) ist so, dass eine große Anzahl von Patienten schon zuvor mit CPI-basierten Therapien behandelt wurde. Es ist aber nicht wohl bekannt, wie frühere CPI-Behandlungen die Reaktion eines Patienten auf neuartige anti-Krebs therapeutische Moleküle beeinflussen. Es wäre bedeutend, um diese Auswirkungen zu verstehen, die „richtige“ Patienten für die Erprobung neuartiger Krebsimmuntherapien in frühen klinischen Studien zu finden. Die Untersuchung der Immunogenität von Patienten gegen die studierte Moleküle ist daher wichtig, da diese Eigenschaft mit der Wirksamkeit der angewandten Immuntherapien verknüpft ist. Zu diesem Zweck wurden Daten aus einer großen virtuellen Kohorte von über 1800 Patienten mit mehr als 20 verschiedenen Krebsarten gesammelt, die an einer von 16 klinischen Phase-1-Studien zur Immuntherapie bei Roche teilgenommen haben. Ergebnisse: In dieser Arbeit stelle ich die deskriptive Analyse dieser Patientenpopulation, die Anreicherung von Immunphänotyp Informationen mit Hilfe von Gensignaturen und eine gründliche Analyse der Behandlungsgeschichte vor. Danach findet eine Mehrfache Korrespondenzanalyse (MCA) für relevante Eigenschaften statt, um die Proben zu unterteilen, und schließlich wird eine Korrelationsanalyse für diese Untergruppen durchgeführt. Potenzielle Zusammenhänge zwischen Aspekten der Behandlungsgeschichte und Immunphänotyp/ROPRO werden diskutiert und während ich sie betrachte, gebe ich einige Empfehlungen für mögliche zukünftige Arbeit, die die hier gemachten Beobachtungen erweitern und die Entscheidung über Auswahlkriterien der Patienten für onkologische Immuntherapie Phase-1-Studien unterstützen können.

Background: Checkpoint Inhibitor (CPI)-based immunotherapies which target the CTLA-4 or PD-1/PD-L1 pathway have achieved impressive success in the treatment of different cancer types. Testing novel cancer immunotherapies in early clinical (Phase 1) studies face the situation that a large number of patients today have been previously exposed to those CPI-based therapies. Little is known about the impact of past CPI-treatments on a patient's response to novel anti-cancer therapeutic molecules. Understanding such impact is important to recruit the “right” patients for testing novel cancer immunotherapies in early clinical studies. Studying the immunogenicity of patients against the studied molecules is therefore important as this property is linked with the effectiveness of the applied immunotherapies. To this end, data has been collected from a large virtual cohort of over 1800 patients with more than 20 different cancer types who participated in one of 16 Phase 1 immunotherapy clinical trials at Roche. Results: In this thesis paper I present the descriptive analysis of this patient population, enrichment of immunophenotype information with the help of gene signatures and thorough analysis of treatment history. Afterwards, multiple correspondence analysis (MCA) takes place on relevant properties to subset the samples and finally correlation analysis is performed on these subsets. Possible relationships between aspects of the treatment history and immunophenotype/ROPRO are discussed and, considering these, some recommendations are provided for possible work in the future that could extend the observations made here and and can support the decision on patient eligibility criteria for oncologic immunotherapy Phase 1 clinical trials.