You are here: University of Vienna PHAIDRA Detail o:2065448
Title (eng)
Nuclear quantum effects at the water/vapor interface from neural network based path integral molecular dynamics simulations
Author
Elias Eingang
Adviser
Christoph Dellago
Assessor
Christoph Dellago
Abstract (deu)

Aufgrund seiner Rolle in vielen natürlichen Prozessen als auch seiner anomalen Eigenschaften steht Wasser im Mittelpunkt zahlreicher Forschungen. Der Atomkern von Wasserstoff besteht aus einem einzelnen Proton, dessen geringe Masse dazu führt, dass Wasser bedeutend von Kernquanteneffekten betroffen ist. Diese Effekte können in Ab-initio Simulationen mit Hilfe des quantenmechanischen Pfadintegralformalismus berücksichtigt werden. Bei der Pfadintegral-Molekulardynamik wird jedes Teilchen als ringartiges Polymer dargestellt, was allerdings den ohnehin schon hohen Rechenaufwand weiter steigert. Um dem entgegenzuwirken, können Methoden neuronaler Netzwerke hinzugezogen werden, was die Rechengeschwindigkeit erhöht und bei vergleichbarer Genauigkeit relevante Größen- und Zeitskalen zugänglich macht. In dieser Arbeit wird ein neuronales Netzwerk-Potential anhand von Energie- und Kraftberechnungen trainiert, die von Dichtefunktionaltheorieberechnungen der Potentialhyperfläche von Wasser in der Revised Perdew–Burke–Ernzerhof Näherung mit Dispersionskorrekturen stammen. Der Einfluss von Kernquanteneffekten auf die Grenzfläche zwischen Wasser und Wasserdampf wird untersucht, indem das neuronale Netzwerkpotential sowohl mit als auch ohne Hinzunahme von Pfadintegral-Molekulardynamik ein System von Wasser simuliert. Strukturelle und thermodynamische Eigenschaften werden entlang der Wasser/Dampf-Koexistenzlinie berechnet um Einsicht in Leistung und Verhalten der Kombination von neuronalen Netzwerk- und Pfadintegralmethoden zu erlangen. Die Ergebnisse zeigen unter Anderem die erwartete Verschiebung des kritischen Punktes bei Inklusion der Kernquanteneffekte, als auch Veränderungen in der bevorzugten Struktur der Wasseroberfläche. Die präsentierten Rechenergebnisse wurden zum Teil am Vienna Scientific Cluster (VSC) erzielt.

Abstract (eng)

Due to its role in many natural processes as well as its anomalous properties, water remains the center of focus for a number of researches. The nuclei of hydrogen atoms are formed by a single proton, whose low mass leads to water being prominently affected by nuclear quantum effects. To include these effects in first principles simulations, a computational method based on the quantum mechanical Feynman path integral formulation is used. Known as path integral molecular dynamics, each particle is treated as a ring polymer to approximate their quantum nature, which further increases the already high computational cost. However, through the use of neural network methods, the speed of calculations can be improved to make the size and time scale needed for meaningful evaluations feasible while retaining high accuracy. In this work, a neural network potential is trained based on reference energies and forces of the density functional theory potential energy surface of water in the Revised Perdew–Burke–Ernzerhof approximation corrected for dispersion. To gauge the impact of nuclear quantum effects on the water/vapor interface, that neural network potential is used both with and without employing path integral molecular dynamics to simulate an interfacial water system. Structural and thermodynamic properties are calculated along the liquid/vapor coexistence line to garner insight of the performance of the combination of path integral molecular dynamics and neural network potentials. The results show the expected shift of the critical point upon inclusion of the nuclear quantum effects, as well as changes in the preferential structure at the water’s surface. The computational results presented have been achieved in part using the Vienna Scientific Cluster (VSC).

Keywords (deu)
Computergestützte PhysikMolekulardynamikPfadintegraleKünstliche neuronale NetzwerkeKernquanteneffekte
Keywords (eng)
computational physicsmolecular dynamicspath integralsartificial neural networksnuclear quantum effects
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:2065448
rdau:P60550 (deu)
ix, 106 Seiten : Illustrationen
Number of pages
118
Study plan
Masterstudium Physics
[UA]
[066]
[876]
Association (deu)
Members (1)
Title (eng)
Nuclear quantum effects at the water/vapor interface from neural network based path integral molecular dynamics simulations
Author
Elias Eingang
Abstract (deu)

Aufgrund seiner Rolle in vielen natürlichen Prozessen als auch seiner anomalen Eigenschaften steht Wasser im Mittelpunkt zahlreicher Forschungen. Der Atomkern von Wasserstoff besteht aus einem einzelnen Proton, dessen geringe Masse dazu führt, dass Wasser bedeutend von Kernquanteneffekten betroffen ist. Diese Effekte können in Ab-initio Simulationen mit Hilfe des quantenmechanischen Pfadintegralformalismus berücksichtigt werden. Bei der Pfadintegral-Molekulardynamik wird jedes Teilchen als ringartiges Polymer dargestellt, was allerdings den ohnehin schon hohen Rechenaufwand weiter steigert. Um dem entgegenzuwirken, können Methoden neuronaler Netzwerke hinzugezogen werden, was die Rechengeschwindigkeit erhöht und bei vergleichbarer Genauigkeit relevante Größen- und Zeitskalen zugänglich macht. In dieser Arbeit wird ein neuronales Netzwerk-Potential anhand von Energie- und Kraftberechnungen trainiert, die von Dichtefunktionaltheorieberechnungen der Potentialhyperfläche von Wasser in der Revised Perdew–Burke–Ernzerhof Näherung mit Dispersionskorrekturen stammen. Der Einfluss von Kernquanteneffekten auf die Grenzfläche zwischen Wasser und Wasserdampf wird untersucht, indem das neuronale Netzwerkpotential sowohl mit als auch ohne Hinzunahme von Pfadintegral-Molekulardynamik ein System von Wasser simuliert. Strukturelle und thermodynamische Eigenschaften werden entlang der Wasser/Dampf-Koexistenzlinie berechnet um Einsicht in Leistung und Verhalten der Kombination von neuronalen Netzwerk- und Pfadintegralmethoden zu erlangen. Die Ergebnisse zeigen unter Anderem die erwartete Verschiebung des kritischen Punktes bei Inklusion der Kernquanteneffekte, als auch Veränderungen in der bevorzugten Struktur der Wasseroberfläche. Die präsentierten Rechenergebnisse wurden zum Teil am Vienna Scientific Cluster (VSC) erzielt.

Abstract (eng)

Due to its role in many natural processes as well as its anomalous properties, water remains the center of focus for a number of researches. The nuclei of hydrogen atoms are formed by a single proton, whose low mass leads to water being prominently affected by nuclear quantum effects. To include these effects in first principles simulations, a computational method based on the quantum mechanical Feynman path integral formulation is used. Known as path integral molecular dynamics, each particle is treated as a ring polymer to approximate their quantum nature, which further increases the already high computational cost. However, through the use of neural network methods, the speed of calculations can be improved to make the size and time scale needed for meaningful evaluations feasible while retaining high accuracy. In this work, a neural network potential is trained based on reference energies and forces of the density functional theory potential energy surface of water in the Revised Perdew–Burke–Ernzerhof approximation corrected for dispersion. To gauge the impact of nuclear quantum effects on the water/vapor interface, that neural network potential is used both with and without employing path integral molecular dynamics to simulate an interfacial water system. Structural and thermodynamic properties are calculated along the liquid/vapor coexistence line to garner insight of the performance of the combination of path integral molecular dynamics and neural network potentials. The results show the expected shift of the critical point upon inclusion of the nuclear quantum effects, as well as changes in the preferential structure at the water’s surface. The computational results presented have been achieved in part using the Vienna Scientific Cluster (VSC).

Keywords (deu)
Computergestützte PhysikMolekulardynamikPfadintegraleKünstliche neuronale NetzwerkeKernquanteneffekte
Keywords (eng)
computational physicsmolecular dynamicspath integralsartificial neural networksnuclear quantum effects
Type (deu)
Persistent identifier
https://phaidra.univie.ac.at/o:2068830
Number of pages
118
Association (deu)