Title (eng)
An R-based automated data evaluation tool for quality control in gas chromatography
Author
Natalie Schmerlaib
Advisor
Lukas Steinberger
Assessor
Lukas Steinberger
Abstract (deu)
Diese Magisterarbeit beschreibt die Umsetzung und Entwicklung einer Applikation in R mit Shiny, die manuelle Schritte in der Auswertung von Gaschromatographie Ergebnissen reduzieren soll. Zusätzlich wird die Möglichkeit einer Qualitätskontrolle implementiert. Im Zuge der Zeitund Fehlerreduktion im Kontext der Digitalisierung wurde eine Applikation entwickelt, die die Auswertung von (gas)chromatographischen Analysen erleichtert. Durch die bisherige manuelle Auswertung der Ergebnisse war das Fehlerrisiko erhöht. Um dieses zu senken, kann mit der entwickelten Applikation diese Auswertung nun automatisch ausgeführt werden. Außerdem ermöglicht die Applikation eine Qualitätskontrolle anhand von Regelkarten (engl. Control Charts). Regelkarten dienen dazu, Kontrollwerte in einer Zeitreihe abzubilden und Grenzen anhand statistischer Werte zu definieren, welche wiederum Signale und Konsequenzen liefern können, wenn Punkte außerhalb dieser Grenzen auftreten. Für die Erstellung der Regelkarten werden die Ergebnisse einer chormatographischen Analyse verwendet, die zur Verfügung gestellten Daten werden hierbei transformiert und bearbeitet. Die Anwendung wurde mithilfe der Programmiersprache R und der Shiny-Umgebung erstellt. Das Projekt ist in Zusammenarbeit mit der österreichischen Biotechnologie-Firma BIOMIN (BIOMIN ist Teil von dsm-firmenich) entstanden.
Abstract (eng)
This thesis describes the implementation of a digitalisation project to automate and improve data analysis in a biotechnological context. The aim is to reduce potential mistakes and save time previously taken up by manually transforming data files generated by gas chromatography instruments. Additionally, quality control measures have been implemented. To achieve these objectives, an application has been developed using the Shiny environment within R. Shiny is an R-based web application framework designed to create reactive applications. Reactivity is necessary to ensure immediate updates in response to user inputs. The aim of this thesis is to construct a user-friendly application structure and obtain deeper insights into quality control by utilising control charts for analysis. Control charts are a visual statistical method for monitoring processes over time, enabling the identification of potential areas for improvement or correction. The program ingests the instrument’s output as input, processes it to extract data of interest, creates control charts, and provides various outputs to the user. This project has been carried out in collaboration with BIOMIN with BIOMIN, an Austrian biotech company (BIOMIN is part of dsm-firmenich).
Keywords (deu)
R-ShinyQualitätskontrolle
Keywords (eng)
quality controlR-basedData evaluation
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Extent (deu)
105 Seiten : Illustrationen
Number of pages
109
Study plan
Magisterstudium Statistik
[UA]
[066]
[951]
Members (1)
Title (eng)
An R-based automated data evaluation tool for quality control in gas chromatography
Author
Natalie Schmerlaib
Abstract (deu)
Diese Magisterarbeit beschreibt die Umsetzung und Entwicklung einer Applikation in R mit Shiny, die manuelle Schritte in der Auswertung von Gaschromatographie Ergebnissen reduzieren soll. Zusätzlich wird die Möglichkeit einer Qualitätskontrolle implementiert. Im Zuge der Zeitund Fehlerreduktion im Kontext der Digitalisierung wurde eine Applikation entwickelt, die die Auswertung von (gas)chromatographischen Analysen erleichtert. Durch die bisherige manuelle Auswertung der Ergebnisse war das Fehlerrisiko erhöht. Um dieses zu senken, kann mit der entwickelten Applikation diese Auswertung nun automatisch ausgeführt werden. Außerdem ermöglicht die Applikation eine Qualitätskontrolle anhand von Regelkarten (engl. Control Charts). Regelkarten dienen dazu, Kontrollwerte in einer Zeitreihe abzubilden und Grenzen anhand statistischer Werte zu definieren, welche wiederum Signale und Konsequenzen liefern können, wenn Punkte außerhalb dieser Grenzen auftreten. Für die Erstellung der Regelkarten werden die Ergebnisse einer chormatographischen Analyse verwendet, die zur Verfügung gestellten Daten werden hierbei transformiert und bearbeitet. Die Anwendung wurde mithilfe der Programmiersprache R und der Shiny-Umgebung erstellt. Das Projekt ist in Zusammenarbeit mit der österreichischen Biotechnologie-Firma BIOMIN (BIOMIN ist Teil von dsm-firmenich) entstanden.
Abstract (eng)
This thesis describes the implementation of a digitalisation project to automate and improve data analysis in a biotechnological context. The aim is to reduce potential mistakes and save time previously taken up by manually transforming data files generated by gas chromatography instruments. Additionally, quality control measures have been implemented. To achieve these objectives, an application has been developed using the Shiny environment within R. Shiny is an R-based web application framework designed to create reactive applications. Reactivity is necessary to ensure immediate updates in response to user inputs. The aim of this thesis is to construct a user-friendly application structure and obtain deeper insights into quality control by utilising control charts for analysis. Control charts are a visual statistical method for monitoring processes over time, enabling the identification of potential areas for improvement or correction. The program ingests the instrument’s output as input, processes it to extract data of interest, creates control charts, and provides various outputs to the user. This project has been carried out in collaboration with BIOMIN with BIOMIN, an Austrian biotech company (BIOMIN is part of dsm-firmenich).
Keywords (deu)
R-ShinyQualitätskontrolle
Keywords (eng)
quality controlR-basedData evaluation
Subject (deu)
Subject (deu)
Type (deu)
Number of pages
109